数学科学学院是学校创建之初设立的院系之一，曾使用数学科、应用数学系、经济管理系、数理信息系、数学与计算机科学系、数学与计算机科学学院、大数据科学学院等名称，2024年经院系整合更名为数学科学学院。学院下设数学系、数据科学系、公共数学部、数学师范教研室、实验中心。

学院现有教师54名，其中教授5名，副教授18名，高级实验师2名，博士30名，硕士生导师16名，教师先后获江西省青年井冈学者、江西省杰出青年学者、江西省教学名师、江西省中青年骨干教师、江西省优秀党务工作者、江西省高校最美辅导员、江西省新时代学生心中的好老师等荣誉。近五年来，学院教师获批国家级科研项目15项，省(部)级科研项目60余项，获江西省教学成果一等奖、二等奖等教学科研奖励多项。在Math. Ann., Transactions of AMS, Science China Mathematics, Inverse Problems等重要期刊发表学术论文300余篇，其中被SCI收录超过100篇。学院教师在全国职业院校技能大赛、江西省高校教师教学创新大赛等重要赛事多次荣获一等奖，数学教师教育课程群教学团队荣获江西省高水平本科教学团队。

学院现有数学一级学科硕士点，学科教学（数学）专业学位硕士点, 数学与应用数学、数据计算及应用2个本科专业, 其中数学一级学科下设有基础数学、应用数学、计算数学等多个二级研究方向，2023年顺利通过硕士学位点评估验收。同时，数学与应用数学专业为国家级一流本科专业建设点、江西省四星级本科专业、江西省一流专业、江西省品牌专业及江西省特色专业，2021年开始招收公费师范生，2023年通过教育部师范类专业二级认证，正在试点从师范与应用两个方向进行分类招生。2023年开办数学创新实验班，面向全校招募学生，自主培养拔尖创新人才。2024年数据计算及应用专业首次招生，以适应数字化智能化社会需求。

学院建有两个南昌市重点实验室：南昌市数学建模重点实验室，南昌市分析数学及其应用重点实验室，为教学和科研工作提供了良好的条件。学校是一所培养职教师资、普教师资和应用型专门人才的多科性本科院校，数学科学学院契合学校培养定位，逐步形成了“一个目标、双轮驱动、三方协同”的人才培养特色，即以“复合创新型人才”为培养目标，以“分类培养、双导师制”双轮进行驱动，地方政府主管部门（产业协会）、高校、企业（中学）等三方协同进行培养的人才培养特色。近三年来，学生在全国大学生建模竞赛、全国大学生数学竞赛、全国师范生技能大赛、全国大学生统计建模竞赛等国家级赛事中均取得较好成绩。